При всем уважении -- надеюсь, вы не будете предъявлять предельно общее исследование (IX-XX вв!!!!) да еще и по истории культуры как отражение современных представлений "про городское самоуправление свободных граждан" и "про то, как бояре защищали свою свободу от царя" :-)
Пред. комментарий со многими ссылками заскринен. Так я без ссылок еще раз порекомендую Горского и По, Кромма и Милова.
А в двух словах одну из богатых мыслей я бы сформулировал так:
в XV-XVI веках боярство в целом успешно защищало свою свободу от великого князя и царя, отстраняя (пытаясь отстранить) последнего от реальных рычагов власти при демонстративном сверхпочитании. Это демонстративное сверхпочитание было нужно московской системе власти для успешной модерации жестких внутриэлитных конфликтов: гордые Шуйские и Воротынские не могли подчиниться ровне. А опричнина стала результатом восстания старомосковского боярства, проигрывавшего княжатам в борьбе за чины, власть и честь, которой неожиданно воспользовался сам монарх. Как то так.